Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSH2P0DML3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSH2P0DML3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms