Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAA2P0DJI9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA2P0DJI9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms