Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2BP0DI82 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms