Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC4P0CG21 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHLRC4P0CG21 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms