Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT16P08779 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT16P08779 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT16P08779 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT16P08779 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT16P08779 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT16P08779 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT16P08779 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT16P08779 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT16P08779 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT16P08779 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT16P08779 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT16P08779 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT16P08779 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT16P08779 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT16P08779 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT16P08779 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT16P08779 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT16P08779 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT16P08779 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT16P08779 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT16P08779 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT16P08779 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT16P08779 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT16P08779 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT16P08779 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT16P08779 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT16P08779 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT16P08779 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT16P08779 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT16P08779 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT16P08779 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT16P08779 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT16P08779 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT16P08779 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT16P08779 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT16P08779 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT16P08779 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT16P08779 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT16P08779 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT16P08779 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT16P08779 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT16P08779 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT16P08779 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT16P08779 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT16P08779 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT16P08779 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT16P08779 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT16P08779 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT16P08779 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT16P08779 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT16P08779 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT16P08779 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT16P08779 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT16P08779 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT16P08779 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT16P08779 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT16P08779 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT16P08779 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT16P08779 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT16P08779 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT16P08779 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms