Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHP08603 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHP08603 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHP08603 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHP08603 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHP08603 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHP08603 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFHP08603 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFHP08603 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFHP08603 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFHP08603 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFHP08603 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFHP08603 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFHP08603 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFHP08603 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFHP08603 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFHP08603 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFHP08603 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFHP08603 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFHP08603 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFHP08603 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFHP08603 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHP08603 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHP08603 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHP08603 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHP08603 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHP08603 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHP08603 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHP08603 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHP08603 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHP08603 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHP08603 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHP08603 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHP08603 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHP08603 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHP08603 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHP08603 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHP08603 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHP08603 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHP08603 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHP08603 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFHP08603 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFHP08603 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFHP08603 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFHP08603 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFHP08603 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFHP08603 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHP08603 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHP08603 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHP08603 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHP08603 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHP08603 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHP08603 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHP08603 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFHP08603 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHP08603 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHP08603 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHP08603 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHP08603 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHP08603 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHP08603 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHP08603 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHP08603 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHP08603 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHP08603 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHP08603 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHP08603 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHP08603 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHP08603 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHP08603 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFHP08603 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFHP08603 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFHP08603 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFHP08603 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFHP08603 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms