Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CSF1RP07333 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CSF1RP07333 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms