Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAVP06756 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAVP06756 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms