Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTMAP06454 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTMAP06454 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTMAP06454 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTMAP06454 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTMAP06454 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTMAP06454 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTMAP06454 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTMAP06454 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTMAP06454 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTMAP06454 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTMAP06454 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTMAP06454 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTMAP06454 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTMAP06454 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTMAP06454 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTMAP06454 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTMAP06454 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTMAP06454 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTMAP06454 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTMAP06454 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTMAP06454 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTMAP06454 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTMAP06454 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTMAP06454 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTMAP06454 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTMAP06454 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTMAP06454 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTMAP06454 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTMAP06454 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTMAP06454 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTMAP06454 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTMAP06454 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTMAP06454 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTMAP06454 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTMAP06454 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTMAP06454 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTMAP06454 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTMAP06454 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTMAP06454 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTMAP06454 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTMAP06454 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTMAP06454 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTMAP06454 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTMAP06454 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTMAP06454 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTMAP06454 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTMAP06454 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTMAP06454 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTMAP06454 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTMAP06454 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTMAP06454 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTMAP06454 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTMAP06454 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTMAP06454 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTMAP06454 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTMAP06454 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTMAP06454 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTMAP06454 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTMAP06454 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTMAP06454 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTMAP06454 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTMAP06454 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTMAP06454 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTMAP06454 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTMAP06454 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTMAP06454 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTMAP06454 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTMAP06454 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTMAP06454 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTMAP06454 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTMAP06454 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTMAP06454 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTMAP06454 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTMAP06454 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms