Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-5P01602 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms