Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST3P01034 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST3P01034 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST3P01034 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST3P01034 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST3P01034 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST3P01034 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST3P01034 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CST3P01034 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST3P01034 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST3P01034 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST3P01034 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST3P01034 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST3P01034 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST3P01034 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST3P01034 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST3P01034 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST3P01034 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST3P01034 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST3P01034 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CST3P01034 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST3P01034 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST3P01034 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST3P01034 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST3P01034 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST3P01034 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST3P01034 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST3P01034 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CST3P01034 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST3P01034 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST3P01034 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST3P01034 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST3P01034 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST3P01034 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST3P01034 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST3P01034 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST3P01034 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST3P01034 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST3P01034 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST3P01034 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST3P01034 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST3P01034 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CST3P01034 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CST3P01034 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CST3P01034 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CST3P01034 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CST3P01034 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CST3P01034 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CST3P01034 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CST3P01034 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CST3P01034 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CST3P01034 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CST3P01034 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST3P01034 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST3P01034 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST3P01034 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST3P01034 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST3P01034 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST3P01034 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST3P01034 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST3P01034 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST3P01034 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CST3P01034 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST3P01034 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST3P01034 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST3P01034 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CST3P01034 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CST3P01034 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST3P01034 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST3P01034 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST3P01034 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CST3P01034 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CST3P01034 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms