Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
S1PR4O95977 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms