Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYF2O95926 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYF2O95926 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYF2O95926 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYF2O95926 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYF2O95926 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYF2O95926 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYF2O95926 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYF2O95926 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYF2O95926 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYF2O95926 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYF2O95926 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYF2O95926 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYF2O95926 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYF2O95926 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYF2O95926 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYF2O95926 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYF2O95926 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYF2O95926 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYF2O95926 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYF2O95926 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYF2O95926 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYF2O95926 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYF2O95926 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYF2O95926 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYF2O95926 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYF2O95926 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYF2O95926 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYF2O95926 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYF2O95926 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYF2O95926 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYF2O95926 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYF2O95926 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYF2O95926 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYF2O95926 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYF2O95926 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYF2O95926 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYF2O95926 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYF2O95926 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYF2O95926 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYF2O95926 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYF2O95926 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYF2O95926 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYF2O95926 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYF2O95926 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYF2O95926 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYF2O95926 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYF2O95926 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYF2O95926 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYF2O95926 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYF2O95926 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYF2O95926 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYF2O95926 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYF2O95926 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYF2O95926 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYF2O95926 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYF2O95926 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYF2O95926 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYF2O95926 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms