Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SEC24BO95487 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24BO95487 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms