Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX3O95343 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX3O95343 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX3O95343 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX3O95343 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX3O95343 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX3O95343 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIX3O95343 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIX3O95343 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIX3O95343 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIX3O95343 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIX3O95343 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX3O95343 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX3O95343 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIX3O95343 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX3O95343 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX3O95343 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX3O95343 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX3O95343 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX3O95343 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX3O95343 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX3O95343 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX3O95343 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX3O95343 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX3O95343 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX3O95343 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX3O95343 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX3O95343 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX3O95343 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX3O95343 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX3O95343 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX3O95343 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX3O95343 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX3O95343 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX3O95343 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX3O95343 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX3O95343 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX3O95343 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX3O95343 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX3O95343 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX3O95343 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX3O95343 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX3O95343 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIX3O95343 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIX3O95343 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIX3O95343 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX3O95343 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX3O95343 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX3O95343 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX3O95343 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX3O95343 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX3O95343 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX3O95343 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX3O95343 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX3O95343 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX3O95343 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX3O95343 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX3O95343 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX3O95343 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX3O95343 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms