Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB11O95342 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCB11O95342 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms