Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALDH1A2O94788 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms