Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F6O75461 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F6O75461 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F6O75461 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F6O75461 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F6O75461 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F6O75461 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F6O75461 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F6O75461 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F6O75461 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F6O75461 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E2F6O75461 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F6O75461 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F6O75461 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F6O75461 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F6O75461 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F6O75461 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F6O75461 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F6O75461 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F6O75461 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F6O75461 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F6O75461 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F6O75461 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F6O75461 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F6O75461 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F6O75461 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F6O75461 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F6O75461 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F6O75461 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F6O75461 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F6O75461 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F6O75461 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F6O75461 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F6O75461 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F6O75461 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F6O75461 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F6O75461 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F6O75461 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F6O75461 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F6O75461 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F6O75461 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F6O75461 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
E2F6O75461 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F6O75461 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms