Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX3O75364 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX3O75364 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX3O75364 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX3O75364 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX3O75364 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX3O75364 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX3O75364 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX3O75364 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX3O75364 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX3O75364 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PITX3O75364 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PITX3O75364 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PITX3O75364 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX3O75364 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX3O75364 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX3O75364 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX3O75364 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms