Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR5O60602 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR5O60602 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR5O60602 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR5O60602 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR5O60602 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR5O60602 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR5O60602 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR5O60602 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR5O60602 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR5O60602 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR5O60602 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR5O60602 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR5O60602 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR5O60602 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR5O60602 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR5O60602 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR5O60602 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR5O60602 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR5O60602 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR5O60602 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR5O60602 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR5O60602 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR5O60602 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR5O60602 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR5O60602 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR5O60602 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR5O60602 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR5O60602 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR5O60602 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR5O60602 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR5O60602 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR5O60602 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR5O60602 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR5O60602 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR5O60602 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR5O60602 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR5O60602 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR5O60602 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR5O60602 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLR5O60602 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLR5O60602 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR5O60602 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR5O60602 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR5O60602 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR5O60602 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR5O60602 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR5O60602 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR5O60602 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR5O60602 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLR5O60602 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR5O60602 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR5O60602 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR5O60602 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR5O60602 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR5O60602 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLR5O60602 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms