Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP104O60308 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP104O60308 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP104O60308 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP104O60308 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP104O60308 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP104O60308 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP104O60308 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP104O60308 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP104O60308 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP104O60308 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP104O60308 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP104O60308 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP104O60308 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP104O60308 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP104O60308 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP104O60308 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP104O60308 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP104O60308 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP104O60308 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP104O60308 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP104O60308 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP104O60308 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP104O60308 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP104O60308 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP104O60308 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP104O60308 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP104O60308 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP104O60308 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP104O60308 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP104O60308 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP104O60308 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP104O60308 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP104O60308 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP104O60308 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP104O60308 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP104O60308 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP104O60308 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP104O60308 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP104O60308 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP104O60308 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP104O60308 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP104O60308 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP104O60308 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP104O60308 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP104O60308 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP104O60308 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms