Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA5O60264 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA5O60264 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms