Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PLIN1O60240 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLIN1O60240 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms