Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP5O60239 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP5O60239 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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