Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EDIL3O43854 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms