Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR3O43761 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR3O43761 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms