Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR2O43760 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms