Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKAB2O43741 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms