Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTATSF1O43719 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTATSF1O43719 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms