Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms