Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPK2O43353 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK2O43353 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms