Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EEF1E1O43324 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EEF1E1O43324 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms