Protein–RNA interactions for Protein: O43309

ZSCAN12, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN12O43309 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZSCAN12O43309 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZSCAN12O43309 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSCAN12O43309 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZSCAN12O43309 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms