Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASKO14936 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASKO14936 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASKO14936 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASKO14936 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASKO14936 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASKO14936 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASKO14936 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASKO14936 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASKO14936 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASKO14936 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASKO14936 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASKO14936 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASKO14936 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASKO14936 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASKO14936 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASKO14936 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASKO14936 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms