Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOCS6O14544 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOCS6O14544 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms