Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM38O00635 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM38O00635 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms