Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL22O00626 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL22O00626 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL22O00626 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL22O00626 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL22O00626 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL22O00626 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL22O00626 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL22O00626 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL22O00626 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL22O00626 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL22O00626 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL22O00626 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL22O00626 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL22O00626 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL22O00626 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL22O00626 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL22O00626 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCL22O00626 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL22O00626 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL22O00626 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL22O00626 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL22O00626 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL22O00626 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL22O00626 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL22O00626 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL22O00626 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL22O00626 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL22O00626 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL22O00626 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL22O00626 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL22O00626 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL22O00626 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL22O00626 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL22O00626 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL22O00626 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL22O00626 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL22O00626 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL22O00626 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL22O00626 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL22O00626 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL22O00626 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL22O00626 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL22O00626 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL22O00626 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL22O00626 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL22O00626 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL22O00626 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL22O00626 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL22O00626 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL22O00626 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL22O00626 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL22O00626 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL22O00626 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL22O00626 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCL22O00626 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCL22O00626 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCL22O00626 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCL22O00626 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL22O00626 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL22O00626 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL22O00626 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL22O00626 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL22O00626 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL22O00626 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL22O00626 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL22O00626 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL22O00626 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL22O00626 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL22O00626 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL22O00626 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL22O00626 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL22O00626 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL22O00626 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms