Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITPNM1O00562 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITPNM1O00562 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITPNM1O00562 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITPNM1O00562 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITPNM1O00562 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms