Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CDO00329 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms