Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIP1O00291 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIP1O00291 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIP1O00291 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIP1O00291 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIP1O00291 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIP1O00291 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIP1O00291 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIP1O00291 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIP1O00291 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HIP1O00291 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HIP1O00291 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIP1O00291 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HIP1O00291 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HIP1O00291 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIP1O00291 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIP1O00291 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIP1O00291 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIP1O00291 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIP1O00291 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIP1O00291 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIP1O00291 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIP1O00291 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HIP1O00291 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIP1O00291 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIP1O00291 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIP1O00291 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIP1O00291 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIP1O00291 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIP1O00291 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIP1O00291 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIP1O00291 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIP1O00291 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIP1O00291 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIP1O00291 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HIP1O00291 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIP1O00291 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIP1O00291 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIP1O00291 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIP1O00291 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIP1O00291 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIP1O00291 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIP1O00291 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIP1O00291 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HIP1O00291 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIP1O00291 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIP1O00291 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HIP1O00291 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIP1O00291 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIP1O00291 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
HIP1O00291 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIP1O00291 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIP1O00291 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIP1O00291 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIP1O00291 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIP1O00291 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIP1O00291 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HIP1O00291 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIP1O00291 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIP1O00291 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIP1O00291 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIP1O00291 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIP1O00291 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIP1O00291 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIP1O00291 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIP1O00291 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIP1O00291 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIP1O00291 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIP1O00291 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIP1O00291 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIP1O00291 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIP1O00291 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIP1O00291 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIP1O00291 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIP1O00291 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIP1O00291 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIP1O00291 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIP1O00291 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIP1O00291 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIP1O00291 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIP1O00291 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIP1O00291 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIP1O00291 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIP1O00291 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIP1O00291 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIP1O00291 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HIP1O00291 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIP1O00291 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIP1O00291 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIP1O00291 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIP1O00291 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIP1O00291 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIP1O00291 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIP1O00291 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIP1O00291 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIP1O00291 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIP1O00291 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIP1O00291 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIP1O00291 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIP1O00291 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms