Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms