Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms