Protein–RNA interactions for Protein: H3BRB1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRB1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
H3BRB1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
H3BRB1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BRB1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BRB1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BRB1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BRB1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BRB1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BRB1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BRB1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BRB1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BRB1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BRB1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BRB1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BRB1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BRB1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BRB1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BRB1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BRB1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BRB1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BRB1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BRB1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BRB1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BRB1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BRB1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BRB1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BRB1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BRB1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BRB1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BRB1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BRB1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BRB1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BRB1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BRB1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BRB1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BRB1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BRB1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BRB1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BRB1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BRB1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BRB1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BRB1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BRB1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BRB1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BRB1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BRB1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BRB1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BRB1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BRB1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BRB1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BRB1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BRB1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BRB1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms