Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8VRH5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
F8VRH5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
F8VRH5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
F8VRH5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8VRH5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8VRH5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8VRH5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8VRH5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8VRH5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8VRH5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8VRH5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8VRH5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8VRH5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8VRH5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F8VRH5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F8VRH5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F8VRH5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F8VRH5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F8VRH5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F8VRH5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F8VRH5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F8VRH5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F8VRH5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F8VRH5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F8VRH5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F8VRH5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F8VRH5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F8VRH5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F8VRH5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F8VRH5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F8VRH5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F8VRH5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F8VRH5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F8VRH5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F8VRH5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
F8VRH5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F8VRH5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
F8VRH5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
F8VRH5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8VRH5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8VRH5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
F8VRH5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms