Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERVV-2B6SEH9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERVV-2B6SEH9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms