Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVV-1B6SEH8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ERVV-1B6SEH8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-1B6SEH8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms