Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DSR2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DSR2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DSR2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
B4DSR2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
B4DSR2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DSR2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DSR2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DSR2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DSR2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DSR2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DSR2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DSR2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DSR2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DSR2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DSR2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B4DSR2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B4DSR2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
B4DSR2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
B4DSR2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
B4DSR2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
B4DSR2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
B4DSR2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B4DSR2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
B4DSR2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B4DSR2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms