Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM233B4DJY2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM233B4DJY2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms