Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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