Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM23A6NLE4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms